微生物多样性测序(16S/ITS扩增子测序)

16S/ITS扩增子测序是对样本中细菌的16S rRNA和真菌的ITS基因序列进行高通量测序。细菌的16S rRNA基因和真菌的ITS基因结构既具有保守性，又具有高变性。通过对某一段高变区序列（如V3-V4区域或ITS1区域）或全长进行PCR扩增后进行高通量测序，与数据库比对得到物种注释信息，可以了解样本中的菌群组成及丰度，以及组间差异菌群。

应用场景（无需分离培养，直接测序）：

（1）了解样本中的物种组成。

（2）了解目的样本内物种丰富度和均匀度信息。

（3）了解样本之间的多样性关系，反映生物群落间的分化程度。

（4）用不同统计学方法分析不同样本/组间物种组成及群落组成差异，寻找具有统计学差异的biomaker。

常用于检测水体、土壤、粪便和其他存在微生物的样本。