单细胞测序技术(Single-Cell Sequencing)是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。它能够揭示细胞间的异质性,在发育生物学、肿瘤学、免疫学、神经科学等领域具有广泛应用。单细胞测序技术正推动生命科学进入“细胞分辨率”时代,在解析细胞异质性(如肿瘤亚克隆、免疫细胞细分)和发现稀有细胞类型(如循环肿瘤细胞、干细胞)具有明显优势。
天科高新技术发展有限公司王庭璋团队基于在单细胞测序领域的技术积累,助力浙江大学/良渚实验室团队开发了一个能在异构数据集上实现疾病特异性细胞亚型统一注释的算法——gPRINT,为疾病特异性细胞亚型注释提供全新解决方案。相关研究成果以“Gene print-based cell subtypes annotation of human disease across heterogeneous datasets with gPRINT”为题,发表于生物学顶级期刊《Protein & Cell》 (IF:13.6, JCR Q1)。
纤维化作为一类以细胞外基质异常沉积为特征的多器官进行性病理过程,正成为全球公共卫生领域的重大挑战,其精准诊疗的核心在于疾病特异性细胞亚型的鉴定。然而,异质性单细胞数据集中标准化注释的难题严重阻碍了纤维化机制解析。本研究在国际上首次提出“基因纹”(gene print)创新概念——通过整合单细胞转录组中基因表达量及其染色体位置信息,构建独特的细胞身份识别模式,并深度融合深度学习技术开发了gPRINT算法。该算法成功突破异构单细胞数据整合瓶颈,首次实现了在异构单细胞数据集上对疾病特异性细胞亚型的统一精准注释,为跨实验室和跨数据集的细胞类型注释提供了稳定高效的解决方案,有望为疾病机制研究和精准治疗带来新的突破。


图1 gPRINT算法流程图
关于浙江天科
浙江天科是由浙江省微生物研究所于2002年整体转制而来,后于2022年划转至浙江省国有资本运营有限公司,是一家集技术研发、技术服务、成果转化为一体的研究型技术服务机构。目前拥有浙江省微生物技术与生物信息研究重点实验室、国家药品监督管理局-药品微生物检测与预警重点实验室。
公司研发中心拥有一支由硕士以上学历人员组成的专业科研和技术服务团队,凭借近40年微生物领域的研发经验,获得省(部)级科技进步奖8项和数十项可供转化的使用成果,现已成为浙江省专业的微生物技术综合解决方案提供商。
目前,公司依托一代、二代和三代测序技术,建立了完整的动植物和微生物相关测序分析平台,尤其在微生物基因组、转录组、宏基因组、环境微生物数据库开发建设等方面拥有丰富的经验。目前,正在构筑开放式生物大数据分析云平台,未来客户可以直接从云端享受我们的优质的技术服务。我们的业务范围主要包括科研服务和科技成果转化两大块模块,合作伙伴囊括了国内外知名学府、科研院所和食品/药品/化妆品相关企业。
